Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CISHQ9NSE2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CISHQ9NSE2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CISHQ9NSE2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CISHQ9NSE2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CISHQ9NSE2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CISHQ9NSE2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 320.2 ms