Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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