Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CHFRQ96EP1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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