Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms