Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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