Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms