Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms