Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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