Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATRQ13535 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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