Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRAF2Q12933 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRAF2Q12933 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRAF2Q12933 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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