Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TROQ12816 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TROQ12816 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TROQ12816 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TROQ12816 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms