Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms