Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNDQ07001 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms