Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EMP3P54852 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 AP002807.1-203ENST00000534517 664 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 AC007570.1-201ENST00000539987 603 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EMP3P54852 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms