Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX5P50542 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX5P50542 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX5P50542 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms