Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AL732372.1-203ENST00000635159 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSEN1P49768 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms