Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCAMP43121 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCAMP43121 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MCAMP43121 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MCAMP43121 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms