Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCHP24723 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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