Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCND1P24385 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCND1P24385 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms