Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPREP23469 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPREP23469 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPREP23469 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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