Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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