Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XBP1P17861 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms