Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA1P17302 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GJA1P17302 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GJA1P17302 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GJA1P17302 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GJA1P17302 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA1P17302 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA1P17302 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA1P17302 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA1P17302 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA1P17302 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA1P17302 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA1P17302 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA1P17302 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA1P17302 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA1P17302 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GJA1P17302 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms