Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms