Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB6

NCDN, Neurochondrin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCDNQ9UBB6 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCDNQ9UBB6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 379.8 ms