Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCAPERQ9BY12 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms