Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms