Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ECHDC3Q96DC8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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