Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms