Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX20Q7Z614 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX20Q7Z614 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms