Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KHDC1Q4VXA5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms