Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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COL24A1Q17RW2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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COL24A1Q17RW2 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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COL24A1Q17RW2 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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COL24A1Q17RW2 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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COL24A1Q17RW2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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COL24A1Q17RW2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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COL24A1Q17RW2 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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