Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYPL1Q16563 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SYPL1Q16563 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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