Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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SSX1Q16384 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SSX1Q16384 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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