Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL9A3Q14050 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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