Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NME3Q13232 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NME3Q13232 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NME3Q13232 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms