Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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