Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLFN5Q08AF3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms