Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms