Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms