Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE3AQ05086 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms