Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms