Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMF1P82094 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMF1P82094 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TMF1P82094 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TMF1P82094 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms