Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC13P55735 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC13P55735 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC13P55735 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC13P55735 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms