Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP5P51878 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP5P51878 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP5P51878 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP5P51878 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP5P51878 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP5P51878 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms