Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPIAP49247 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPIAP49247 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPIAP49247 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPIAP49247 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms