Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms