Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms