Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ETFBP38117 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms