Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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